保稅區依照自由貿易區模式，采取某些自由港政策，按國際慣例運作。在保稅區內使用的進口生産設備、物資、辦公用品以及加工出口所需料件包裝物料等免征進口關稅、增值稅、消費稅；貨物從境外運入保稅區或從保稅區運出境外，免關稅、免許可證。

沙頭角保稅區：現規劃區內用地30萬平方米，以發展先進的外向型工業爲主，幷適當發展進出口貿易、轉口貿易、倉儲、運輸、房地産及其它第三産業。

福田保稅區：現有開發面積爲1.35平方公里，配套生活區面積0.63平方公里。主要發展國際貿易、倉儲、先進工業及高新技術産業，相應發展金融、信息、商品展示、商貿服務行業。

鹽田港保稅區：首期開發0.85平方公里，以發展轉口貿易和倉儲功能爲主，適當發展保稅區生産資料市場、商品展銷、分類、改裝、混合、加工及金融、保險、信息、運輸等業務。

高新技術産業園區

深圳市高新技術産業園區屬中國國家級高新技術産業園區，占地面積11.5平方公里。主要發展電子信息、生物工程、新材料、光機電一體化等四大産業，其中電子信息産業是高新區的重點支柱産業。

龍崗大工業區

龍崗大工業區面積174.4平方公里，可建設用地109平方公里，規劃面積80.9平方公里。大工業區作爲大型工業基地，以製造業爲主體，以先進技術工業項目爲核心，配套興辦金融、房地産、貿易、服務業等第三産業，大力發展計算機及其軟件、微電子及元器件、通訊産業、視聽産業、機電一體化、儀器儀錶、精細化工、醫藥及生物工程工業、金屬材料工業、輕紡工業、機械加工和汽車工業等先進技術産業和基礎産業。